Analyse d'image


Au sein de la plateforme SC3M, nous proposons des services d’analyse des images médicales et biologiques.

Nous pouvons proposer divers traitements sur tous les formats d’images (2D, 3D,…).

Nous sommes régulièrement amenés à travailler sur des images provenant de différentes sources d’acquisitions (images de MEB, MET, micro-scanner, IRM, microscopie, confocal, …).

Voici un échantillon des différentes analyses que nous pouvons proposer :

  • Comptage de cellules (en 2D / 3D)
  • Caractérisation des cellules (mesures de distances, superficie, périmètres, …)
  • Estimation de la densité des cellules,
  • Mesure de la densité osseuse (en 2D / 3D),
  • Mesure de la sphéricité de divers composants,
  • Analyse statistique sur des données volumineuse,
  • Quantification de diverses matières dans les images,
  • Caractérisation géométriques de diverses formes (arbre vasculaire par exemple),
  • Reconnaissance des formes au sens large,
  • En fonction des exigences, il est possible de proposer des outils requérant une intervention humaine (sélection manuelle de couleurs, de formes ou de seuils de segmentation), ou alors les outils peuvent être complètement automatiques et ne requérir aucune intervention humaine. En fonction des besoins, il sera possible de fournir un outil d’analyse d’image se présentant sous plusieurs formes: Un logiciel autonome/indépendant, un plugin sous ImageJ/Fiji ou 3D Slicer, une application web, …
Mis à jour le 21 mai 2021.
https://sc3m.ppksup.univ-nantes.fr/microscopie-electronique/analyse-dimage